Според теб защо можеш да чекнеш всички радио бутони ? Ти си набутал цялата форма в цикъла. Т.е. при всяко завъртане на цикъла ти създаваш нова форма, вместо само нов бутон. Изведи формата извън цикъла и остави бутона само.
Колкото до горния ти въпрос. Ами няма разлика. Всеки предпочита различно. Аз принципно като меша HTML и PHP правя така: