И на мен ми се е случвало подобно нещо... По принцип аз създавам ново изображение със същия размер (File -> New) и копирам GIF изображението като го поставям в новия документ под формата на нов слой. Целта е самата картинка да не е основа (background) а да съществува като независим Layer, за да може да се третира с инструментите.